Chùa Đại Từ Ân được xây dựng tại Khu Đô thị Sinh thái Cao cấp Đan Phượng thuộc thị trấn Phùng, huyện Đan Phượng, TP. Hà Nội.  Tiền thân trước đây khu vực này vốn là một ngôi chùa cổ, nhưng qua chiến tranh ngôi chùa đã bị tàn phá. Năm 2010, tập đoàn DIA muốn xây dựng toàn bộ khu đất này thành khu đô thị lớn với hệ thống trung tâm thương mại, .